En los años 90´s, muchas madres decian de cosas al escuchar que sus hijos llegaban diciendo "mamá!!! logre sacarle el corazón a un ninja con un tipo que tiene cara de robot!!!" o "Con un ninja azul le arranqué la cabeza a otro"; bienvenidos a Mortal Kombat.
Después de las incursiones en los kombates de 360° y algunos crossovers pésimos (MK vs DC), NetherRealm corrigió sus errores con este nuevo MK que retoma los kombates en 2D, los fatalities, babalities y stage fatalities, la movilidad se mejoró y se mantuvo el sitema de kombos del Deception y Anihilation.
La historia comienza con una batalla entre Raiden y Shao Khan, al pie de una pirámide todos los kombatientes estan muertos, entonces Raiden decide mandar un mensaje a su yo del pasado para evitar esa masacre. El Raiden del pasado recibe unas visiones de todas las muertes y advierte a los participantes que deben de ganar a toda costa, principalmente Liu Kang; pero al derrotar a Shang Tsung el amuleto de Raiden (que es si "indicador" de los eventos futuros sigue rompiéndose, lo que indica que nada ha cambiado.
Posteriormente se deben enfrentar a Shao Khan, y ahora es Kung Lao el que debe ganar, pero el resultado de el torneo es la muerte de Kung Lao y el amuleto sigue rompiéndose. Todo el modo historia se desarrolla durante lo que es MK 1, 2 y 3, cubre bastante parte de la historia, incluso la lista de peleadores es bastante amplia. algo añadido es un modo llamado torre de los retos, donde se tiene que completar misiones (un total de 300), al ir avanzando se desbloquean minijuegos como "prueba tu suerte", "prueba tu fuerza" (todo un clásico de MK), "prueba tu vista"; también al avanzae en el modo historia y en la escalera (modo arcade) dan monedas que se puedan gastar en la Kripta, donde desbloquearemos imágenes, música, trajes alternativos y fatalities; una novedad del juego es el movimiento X-Ray, que se va llenando conforme al daño que recibamos o los ataques que nos sean bloqueados.